系统管理员的主要权限包括：
1. 用户管理权限：管理员可以创建、修改和删除系统中的用户，包括用户的基本信息、密码、角色等。管理员还可以对用户进行分组，以便更好地管理和监控不同的用户组。
2. 权限管理权限：管理员可以分配或取消用户对特定资源的访问权限。例如，管理员可以将某个文件或文件夹设置为只读，或者将某个程序的执行权赋予特定的用户。这样，只有被授权的用户才能访问和使用这些资源。
3. 文件和目录管理权限：管理员可以创建、修改和删除系统中的文件和目录。管理员还可以对文件和目录进行重命名、移动、复制、删除等操作。这样可以方便地组织和管理系统中的文件和数据。
4. 系统设置权限：管理员可以配置系统的参数和选项，以满足系统运行的需求。例如，管理员可以设置系统的启动顺序、网络连接方式、安全策略等。这样可以确保系统在各种环境下都能正常运行。
5. 备份和恢复权限：管理员可以定期备份系统中的重要数据，以防止数据丢失。同时，管理员还可以在系统出现问题时，从备份中恢复数据，以减少损失。
6. 性能优化权限：管理员可以监控系统的性能，分析系统瓶颈，并采取相应的措施进行优化。例如，管理员可以调整系统的配置参数，优化代码结构，提高系统的运行效率。
7. 审计和监控权限：管理员可以记录系统中的操作日志，便于追踪问题和审计系统的安全状况。同时，管理员还可以监控系统的运行状态，发现异常情况并及时处理。
8. 故障排查和修复权限：当系统出现故障时，管理员可以快速定位问题并进行修复。管理员还可以利用一些工具和技术来帮助自己解决问题，提高工作效率。
9. 软件安装和更新权限：管理员可以安装、卸载或升级系统中的软件。这样可以确保软件的版本与系统兼容，满足用户需求。
10. 邮件和通知权限：管理员可以发送邮件通知用户系统的变化和更新，也可以接收来自用户的反馈和建议。这样可以保持用户与系统之间的良好沟通，提高用户体验。
总之，系统管理员的主要权限涵盖了用户管理、权限管理、文件和目录管理、系统设置、备份和恢复、性能优化、审计和监控、故障排查和修复、软件安装和更新以及邮件和通知等多个方面。通过合理分配和管理这些权限，可以确保系统安全稳定地运行，满足用户的需求。